1. Ofrecer programas que ayuden a desarrollar la capacidad de investigación y construcción del conocimiento que permita interrogar y significar la práctica educativa y de gestión.

2. Brindar espacios para el manejo de los conocimientos teóricos, instrumentos y técnicas necesarios para formular proyectos, planes y programas tendientes a las necesarias transformaciones de la práctica en función a la misión social pertinente.

3. Desarrollar capacidades de intervención, dirigida a producir innovaciones en la gestión pedagógica, social, administrativa y financiera en los diferentes niveles del sistema social del país.

4. Desarrollar la autonomía profesional y personal para responder a demandas socioculturales, políticas, económicas de la sociedad y a procesos complejos de organización que conllevan las relaciones interpersonales.

5. Propiciar la incorporación y el manejo de conocimientos específicos, técnicos y habilidades necesarias para la adecuada administración  de una micro y macro gestión socioeducativa.

6. Ofrecer una amplia y sólida preparación pedagógica y social  que permita al estudiante entender en toda su magnitud el fenómeno socioeducativo a través de la planificación, ejecución, monitoreo y evaluación.

7. Elevar la competencia profesional de modo que se fortalezca la participación comprometida de los profesionales de la educación como agentes dinamizadores del proceso social y educativo en el ámbito espiritual, moral, profesional e intelectual.

La Universidad Evangélica del Paraguay patrocina la filosofía, los valores y la alta política de la Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educación.

El gobierno inmediato de la FAHCE es ejercido por un Decano y un Consejo  en la forma establecida en sus estatutos.

El DECANO es el representante legal de la Universidad, con atribuciones para disponer la ejecución y el cumplimiento de las resoluciones sancionadas a nivel de la Junta Directiva de la Universidad Evangélica y el Consejo Universitario.

La organización académica comprende divisiones técnico - administrativas y facultades académicas divididas en departamentos. Las facultades dirigen la enseñanza de carreras afines.

La organización administrativa se halla a cargo de divisiones: de finanzas, de servicios generales, de personal y de servicios estudiantiles, todas ellas auxiliadas por un sistema de información de datos computarizados, que a su vez mantiene  el registro y el seguimiento estudiantil.